Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms