Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms