Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
PRKAB2O43741 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKAB2O43741 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms