Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms