Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCP110O43303 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCP110O43303 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCP110O43303 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCP110O43303 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCP110O43303 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCP110O43303 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCP110O43303 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCP110O43303 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCP110O43303 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCP110O43303 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCP110O43303 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCP110O43303 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCP110O43303 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCP110O43303 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCP110O43303 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCP110O43303 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCP110O43303 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCP110O43303 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCP110O43303 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCP110O43303 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCP110O43303 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCP110O43303 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCP110O43303 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCP110O43303 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCP110O43303 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCP110O43303 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCP110O43303 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCP110O43303 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCP110O43303 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCP110O43303 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCP110O43303 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCP110O43303 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCP110O43303 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCP110O43303 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCP110O43303 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCP110O43303 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCP110O43303 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCP110O43303 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCP110O43303 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCP110O43303 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCP110O43303 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCP110O43303 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCP110O43303 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCP110O43303 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCP110O43303 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCP110O43303 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCP110O43303 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCP110O43303 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCP110O43303 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCP110O43303 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCP110O43303 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCP110O43303 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCP110O43303 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCP110O43303 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCP110O43303 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCP110O43303 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCP110O43303 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCP110O43303 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCP110O43303 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCP110O43303 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCP110O43303 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCP110O43303 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCP110O43303 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCP110O43303 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCP110O43303 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCP110O43303 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCP110O43303 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCP110O43303 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCP110O43303 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCP110O43303 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCP110O43303 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCP110O43303 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCP110O43303 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCP110O43303 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCP110O43303 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCP110O43303 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCP110O43303 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCP110O43303 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCP110O43303 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCP110O43303 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCP110O43303 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCP110O43303 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCP110O43303 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCP110O43303 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCP110O43303 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCP110O43303 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCP110O43303 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCP110O43303 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCP110O43303 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCP110O43303 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCP110O43303 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCP110O43303 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCP110O43303 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCP110O43303 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCP110O43303 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCP110O43303 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCP110O43303 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCP110O43303 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCP110O43303 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms