Protein–RNA interactions for Protein: O15335

CHAD, Chondroadherin, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHADO15335 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHADO15335 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHADO15335 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHADO15335 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHADO15335 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHADO15335 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHADO15335 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHADO15335 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHADO15335 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHADO15335 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHADO15335 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHADO15335 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHADO15335 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHADO15335 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHADO15335 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHADO15335 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHADO15335 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CHADO15335 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHADO15335 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHADO15335 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHADO15335 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHADO15335 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHADO15335 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHADO15335 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHADO15335 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CHADO15335 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHADO15335 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHADO15335 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHADO15335 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHADO15335 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHADO15335 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHADO15335 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHADO15335 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHADO15335 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHADO15335 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHADO15335 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHADO15335 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHADO15335 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHADO15335 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHADO15335 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHADO15335 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHADO15335 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHADO15335 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHADO15335 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHADO15335 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHADO15335 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHADO15335 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHADO15335 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHADO15335 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHADO15335 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHADO15335 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHADO15335 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHADO15335 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHADO15335 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHADO15335 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHADO15335 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHADO15335 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHADO15335 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHADO15335 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CHADO15335 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHADO15335 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHADO15335 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHADO15335 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHADO15335 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHADO15335 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHADO15335 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHADO15335 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHADO15335 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHADO15335 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHADO15335 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHADO15335 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHADO15335 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHADO15335 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHADO15335 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHADO15335 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHADO15335 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHADO15335 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHADO15335 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHADO15335 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHADO15335 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHADO15335 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHADO15335 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CHADO15335 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHADO15335 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHADO15335 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHADO15335 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHADO15335 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CHADO15335 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHADO15335 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHADO15335 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHADO15335 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHADO15335 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHADO15335 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHADO15335 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHADO15335 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHADO15335 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHADO15335 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHADO15335 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHADO15335 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHADO15335 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms