Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
APAF1O14727 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
APAF1O14727 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
APAF1O14727 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
APAF1O14727 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
APAF1O14727 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
APAF1O14727 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
APAF1O14727 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
APAF1O14727 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
APAF1O14727 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
APAF1O14727 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
APAF1O14727 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
APAF1O14727 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
APAF1O14727 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
APAF1O14727 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
APAF1O14727 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
APAF1O14727 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
APAF1O14727 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
APAF1O14727 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
APAF1O14727 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
APAF1O14727 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
APAF1O14727 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
APAF1O14727 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
APAF1O14727 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
APAF1O14727 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
APAF1O14727 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
APAF1O14727 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
APAF1O14727 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
APAF1O14727 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
APAF1O14727 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
APAF1O14727 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
APAF1O14727 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
APAF1O14727 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
APAF1O14727 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
APAF1O14727 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
APAF1O14727 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
APAF1O14727 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
APAF1O14727 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
APAF1O14727 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
APAF1O14727 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
APAF1O14727 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
APAF1O14727 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
APAF1O14727 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
APAF1O14727 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
APAF1O14727 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
APAF1O14727 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
APAF1O14727 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
APAF1O14727 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
APAF1O14727 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
APAF1O14727 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
APAF1O14727 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
APAF1O14727 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
APAF1O14727 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
APAF1O14727 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
APAF1O14727 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
APAF1O14727 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
APAF1O14727 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
APAF1O14727 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
APAF1O14727 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
APAF1O14727 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
APAF1O14727 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
APAF1O14727 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
APAF1O14727 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
APAF1O14727 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
APAF1O14727 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
APAF1O14727 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
APAF1O14727 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
APAF1O14727 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
APAF1O14727 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
APAF1O14727 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
APAF1O14727 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
APAF1O14727 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
APAF1O14727 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
APAF1O14727 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
APAF1O14727 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
APAF1O14727 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
APAF1O14727 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
APAF1O14727 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
APAF1O14727 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
APAF1O14727 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
APAF1O14727 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
APAF1O14727 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
APAF1O14727 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
APAF1O14727 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
APAF1O14727 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
APAF1O14727 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
APAF1O14727 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
APAF1O14727 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
APAF1O14727 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
APAF1O14727 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
APAF1O14727 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
APAF1O14727 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
APAF1O14727 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
APAF1O14727 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
APAF1O14727 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
APAF1O14727 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
APAF1O14727 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
APAF1O14727 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
APAF1O14727 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
APAF1O14727 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms