Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.7 ms