Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.9 ms