Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NEMP2A6NFY4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEMP2A6NFY4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEMP2A6NFY4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEMP2A6NFY4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEMP2A6NFY4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEMP2A6NFY4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEMP2A6NFY4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEMP2A6NFY4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEMP2A6NFY4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEMP2A6NFY4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEMP2A6NFY4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEMP2A6NFY4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEMP2A6NFY4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEMP2A6NFY4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEMP2A6NFY4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEMP2A6NFY4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NEMP2A6NFY4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEMP2A6NFY4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEMP2A6NFY4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEMP2A6NFY4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEMP2A6NFY4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEMP2A6NFY4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEMP2A6NFY4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEMP2A6NFY4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEMP2A6NFY4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms