Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.073e-7■■■■■ 31
SF3B1O75533 HSPA8-211ENST00000527983 1509 ntTSL 1 (best)12.39□□□□□ -0.433e-7■■■■■ 31
SF3B1O75533 HSPA8-217ENST00000532182 674 ntTSL 412.26□□□□□ -0.453e-7■■■■■ 31
SF3B1O75533 HSPA8-218ENST00000532636 2306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.623e-7■■■■■ 31
SF3B1O75533 HSPA8-220ENST00000533238 465 ntTSL 36.89□□□□□ -1.313e-7■■■■■ 31
SF3B1O75533 HSPA8-212ENST00000528292 1112 ntTSL 26.66□□□□□ -1.343e-7■■■■■ 31
SF3B1O75533 HSPA8-216ENST00000532167 570 ntTSL 44.35□□□□□ -1.713e-7■■■■■ 31
SF3B1O75533 HSPA8-205ENST00000525463 583 ntTSL 53.56□□□□□ -1.843e-7■■■■■ 31
SF3B1O75533 HSPA8-214ENST00000531063 578 ntTSL 22.93□□□□□ -1.943e-7■■■■■ 31
SF3B1O75533 HSPA8-204ENST00000524590 536 ntTSL 52.73□□□□□ -1.973e-7■■■■■ 31
SF3B1O75533 SLC3A2-214ENST00000539507 534 ntTSL 37.45□□□□□ -1.226e-7■■■■■ 31
SF3B1O75533 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.031e-6■■■■■ 30.9
SF3B1O75533 HBP1-208ENST00000468410 2704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.081e-6■■■■■ 30.9
SF3B1O75533 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.232e-12■■■■■ 30.9
SF3B1O75533 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.072e-6■■■■■ 30.9
SF3B1O75533 RANBP1-210ENST00000435265 1879 ntTSL 220.69■□□□□ 0.92e-6■■■■■ 30.9
SF3B1O75533 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.112e-6■■■■■ 30.9
SF3B1O75533 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.072e-6■■■■■ 30.9
SF3B1O75533 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.023e-6■■■■■ 30.9
SF3B1O75533 MKNK2-205ENST00000586828 1503 ntTSL 221.3■■□□□ 13e-6■■■■■ 30.9
SF3B1O75533 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.193e-6■■■■■ 30.9
SF3B1O75533 MKNK2-213ENST00000591601 3582 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.473e-6■■■■■ 30.9
SF3B1O75533 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.323e-6■■■■■ 30.9
SF3B1O75533 ZNF146-202ENST00000456324 3780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.867e-9■■■■■ 30.8
SF3B1O75533 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.397e-9■■■■■ 30.8
SF3B1O75533 BUB1-206ENST00000465029 1999 ntTSL 214.07□□□□□ -0.163e-6■■■■■ 30.8
SF3B1O75533 BUB1-207ENST00000466333 2501 ntTSL 1 (best)6.75□□□□□ -1.333e-6■■■■■ 30.8
SF3B1O75533 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.324e-8■■■■■ 30.8
SF3B1O75533 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.478e-7■■■■■ 30.8
SF3B1O75533 MAT2A-205ENST00000481412 1438 ntTSL 1 (best)13.43□□□□□ -0.268e-7■■■■■ 30.8
SF3B1O75533 MPP1-207ENST00000428488 581 ntTSL 314.46□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 30.8
SF3B1O75533 CCNL2-216ENST00000488340 1598 ntTSL 223.49■■□□□ 1.352e-7■■■■■ 30.7
SF3B1O75533 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.722e-7■■■■■ 30.7
SF3B1O75533 CCNL2-213ENST00000481223 2815 ntTSL 218.78■□□□□ 0.62e-7■■■■■ 30.7
SF3B1O75533 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.542e-7■■■■■ 30.7
SF3B1O75533 CCNL2-218ENST00000496007 4452 ntTSL 213.67□□□□□ -0.222e-7■■■■■ 30.7
SF3B1O75533 GOLGA4-207ENST00000437131 6947 ntTSL 1 (best)2.38□□□□□ -2.032e-6■■■■■ 30.7
SF3B1O75533 GOLGA3-207ENST00000545875 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.614e-6■■■■■ 30.7
SF3B1O75533 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.222e-6■■■■■ 30.7
SF3B1O75533 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.082e-6■■■■■ 30.7
SF3B1O75533 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.52e-6■■■■■ 30.7
SF3B1O75533 YY1AP1-207ENST00000361140 2701 ntTSL 1 (best)16.52■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 30.7
SF3B1O75533 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 30.7
SF3B1O75533 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 30.7
SF3B1O75533 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.122e-6■■■■■ 30.7
SF3B1O75533 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.152e-6■■■■■ 30.7
SF3B1O75533 YY1AP1-205ENST00000355499 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.22e-6■■■■■ 30.7
SF3B1O75533 YY1AP1-209ENST00000368330 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.522e-6■■■■■ 30.7
SF3B1O75533 YY1AP1-204ENST00000354691 2498 ntTSL 211.44□□□□□ -0.582e-6■■■■■ 30.7
SF3B1O75533 YY1AP1-215ENST00000436865 2684 ntTSL 1 (best)9.1□□□□□ -0.952e-6■■■■■ 30.7
SF3B1O75533 YY1AP1-203ENST00000347088 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -12e-6■■■■■ 30.7
SF3B1O75533 ADAMTSL4-205ENST00000483335 1826 ntTSL 1 (best)17.04■□□□□ 0.322e-6■■■■■ 30.7
SF3B1O75533 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.023e-6■■■■■ 30.7
SF3B1O75533 SEMA4C-203ENST00000449330 839 ntTSL 315.95■□□□□ 0.141e-6■■■■■ 30.7
SF3B1O75533 ZMYND8-214ENST00000467200 3634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)9.91□□□□□ -0.821e-6■■■■■ 30.6
SF3B1O75533 GOLGA2-208ENST00000486411 591 ntTSL 321.26■□□□□ 0.998e-9■■■■■ 30.6
SF3B1O75533 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.79e-8■■■■■ 30.6
SF3B1O75533 ARID1A-208ENST00000532781 2583 ntTSL 1 (best)14.35□□□□□ -0.117e-7■■■■■ 30.6
SF3B1O75533 AARSD1-212ENST00000486664 648 ntTSL 313.23□□□□□ -0.298e-9■■■■■ 30.6
SF3B1O75533 ARID1A-206ENST00000466382 2699 ntTSL 212.7□□□□□ -0.387e-7■■■■■ 30.6
SF3B1O75533 ARID1A-217ENST00000637788 3046 nt10.71□□□□□ -0.697e-7■■■■■ 30.6
SF3B1O75533 MVD-214ENST00000567064 758 ntTSL 320.39■□□□□ 0.852e-6■■■■■ 30.6
SF3B1O75533 MVD-216ENST00000568709 809 ntTSL 520.31■□□□□ 0.842e-6■■■■■ 30.6
SF3B1O75533 MVD-208ENST00000563785 888 ntTSL 220.18■□□□□ 0.822e-6■■■■■ 30.6
SF3B1O75533 MVD-217ENST00000569177 870 ntTSL 518.34■□□□□ 0.532e-6■■■■■ 30.6
SF3B1O75533 MVD-215ENST00000568133 853 ntTSL 317.97■□□□□ 0.472e-6■■■■■ 30.6
SF3B1O75533 MVD-206ENST00000563170 904 ntTSL 317.95■□□□□ 0.462e-6■■■■■ 30.6
SF3B1O75533 PHF21A-219ENST00000533757 466 ntTSL 54.92□□□□□ -1.623e-6■■■■■ 30.6
SF3B1O75533 PHF21A-216ENST00000532010 546 ntTSL 44.75□□□□□ -1.653e-6■■■■■ 30.6
SF3B1O75533 PHF21A-209ENST00000527782 490 ntTSL 43.66□□□□□ -1.823e-6■■■■■ 30.6
SF3B1O75533 PHF21A-204ENST00000525438 577 ntTSL 42.87□□□□□ -1.953e-6■■■■■ 30.6
SF3B1O75533 PHF21A-210ENST00000528893 457 ntTSL 31.89□□□□□ -2.113e-6■■■■■ 30.6
SF3B1O75533 RPL10-217ENST00000492572 1656 ntTSL 518.25■□□□□ 0.514e-9■■■■■ 30.6
SF3B1O75533 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.054e-9■■■■■ 30.6
SF3B1O75533 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.074e-9■■■■■ 30.6
SF3B1O75533 RPL10-210ENST00000458500 585 ntTSL 1 (best)14.55□□□□□ -0.084e-9■■■■■ 30.6
SF3B1O75533 RPL10-215ENST00000489200 1519 ntTSL 213.79□□□□□ -0.24e-9■■■■■ 30.6
SF3B1O75533 RPL10-214ENST00000485196 839 ntTSL 213.1□□□□□ -0.314e-9■■■■■ 30.6
SF3B1O75533 RPL10-218ENST00000618723 2210 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.334e-9■■■■■ 30.6
SF3B1O75533 RPL10-207ENST00000436473 657 ntTSL 212.71□□□□□ -0.374e-9■■■■■ 30.6
SF3B1O75533 RPL10-204ENST00000424325 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.434e-9■■■■■ 30.6
SF3B1O75533 RPL10-211ENST00000467168 802 ntTSL 211.72□□□□□ -0.534e-9■■■■■ 30.6
SF3B1O75533 RPL10-213ENST00000482732 1731 ntTSL 1 (best)11.6□□□□□ -0.554e-9■■■■■ 30.6
SF3B1O75533 RPL10-216ENST00000491035 1369 ntTSL 511.53□□□□□ -0.564e-9■■■■■ 30.6
SF3B1O75533 RPL10-201ENST00000344746 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)11.44□□□□□ -0.584e-9■■■■■ 30.6
SF3B1O75533 GFPT1-201ENST00000357308 8703 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.013e-6■■■■■ 30.6
SF3B1O75533 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.263e-6■■■■■ 30.6
SF3B1O75533 COQ8A-206ENST00000479852 1938 ntTSL 1 (best)22.42■■□□□ 1.183e-6■■■■■ 30.6
SF3B1O75533 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.338e-7■■■■■ 30.6
SF3B1O75533 COQ8A-207ENST00000485462 2141 ntTSL 1 (best)16.21■□□□□ 0.183e-6■■■■■ 30.6
SF3B1O75533 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.188e-7■■■■■ 30.6
SF3B1O75533 PPIG-205ENST00000418888 525 ntTSL 414.92□□□□□ -0.022e-7■■■■■ 30.6
SF3B1O75533 KEL-208ENST00000479768 1856 ntTSL 513.9□□□□□ -0.183e-6■■■■■ 30.6
SF3B1O75533 KEL-201ENST00000355265 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.923e-6■■■■■ 30.6
SF3B1O75533 EIF2AK1-203ENST00000431744 806 ntTSL 328.56■■■□□ 2.161e-8■■■■■ 30.6
SF3B1O75533 EIF2AK1-204ENST00000446699 573 ntTSL 428.56■■■□□ 2.161e-8■■■■■ 30.6
SF3B1O75533 NSFL1C-207ENST00000478168 624 ntTSL 223.17■■□□□ 1.31e-8■■■■■ 30.6
SF3B1O75533 NSFL1C-211ENST00000555359 450 ntTSL 323.17■■□□□ 1.31e-8■■■■■ 30.6
SF3B1O75533 EIF2AK1-205ENST00000461493 631 ntTSL 221.85■■□□□ 1.091e-8■■■■■ 30.6
SF3B1O75533 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.931e-8■■■■■ 30.6
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 3208.3 ms