Protein–RNA interactions for Protein: V9GYQ6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYQ6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
V9GYQ6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
V9GYQ6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
V9GYQ6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
V9GYQ6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
V9GYQ6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
V9GYQ6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
V9GYQ6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
V9GYQ6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
V9GYQ6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
V9GYQ6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
V9GYQ6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
V9GYQ6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
V9GYQ6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
V9GYQ6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
V9GYQ6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
V9GYQ6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
V9GYQ6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
V9GYQ6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
V9GYQ6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
V9GYQ6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
V9GYQ6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
V9GYQ6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
V9GYQ6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
V9GYQ6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
V9GYQ6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
V9GYQ6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
V9GYQ6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
V9GYQ6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
V9GYQ6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
V9GYQ6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
V9GYQ6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
V9GYQ6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
V9GYQ6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
V9GYQ6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
V9GYQ6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
V9GYQ6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
V9GYQ6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
V9GYQ6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
V9GYQ6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
V9GYQ6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
V9GYQ6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
V9GYQ6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
V9GYQ6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
V9GYQ6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
V9GYQ6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
V9GYQ6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYQ6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYQ6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYQ6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYQ6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYQ6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYQ6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYQ6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYQ6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYQ6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYQ6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYQ6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYQ6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYQ6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYQ6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYQ6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYQ6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYQ6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYQ6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYQ6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYQ6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYQ6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYQ6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYQ6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYQ6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYQ6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYQ6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYQ6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYQ6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYQ6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYQ6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYQ6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYQ6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYQ6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYQ6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYQ6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYQ6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYQ6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYQ6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYQ6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYQ6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYQ6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYQ6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYQ6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYQ6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYQ6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYQ6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYQ6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYQ6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYQ6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYQ6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYQ6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYQ6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
V9GYQ6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms