Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC61Q9Y6R9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms