Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms