Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX10Q9Y5X0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms