Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W9

SNX11, Sorting nexin-11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11Q9Y5W9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX11Q9Y5W9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX11Q9Y5W9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX11Q9Y5W9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX11Q9Y5W9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX11Q9Y5W9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX11Q9Y5W9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX11Q9Y5W9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX11Q9Y5W9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX11Q9Y5W9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX11Q9Y5W9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX11Q9Y5W9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX11Q9Y5W9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX11Q9Y5W9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX11Q9Y5W9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX11Q9Y5W9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX11Q9Y5W9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms