Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
KLHDC2Q9Y2U9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms