Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y297

BTRC, F-box/WD repeat-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BTRCQ9Y297 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BTRCQ9Y297 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BTRCQ9Y297 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BTRCQ9Y297 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BTRCQ9Y297 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BTRCQ9Y297 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BTRCQ9Y297 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BTRCQ9Y297 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BTRCQ9Y297 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BTRCQ9Y297 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BTRCQ9Y297 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BTRCQ9Y297 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BTRCQ9Y297 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BTRCQ9Y297 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
BTRCQ9Y297 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BTRCQ9Y297 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BTRCQ9Y297 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BTRCQ9Y297 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BTRCQ9Y297 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BTRCQ9Y297 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BTRCQ9Y297 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BTRCQ9Y297 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BTRCQ9Y297 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BTRCQ9Y297 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BTRCQ9Y297 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BTRCQ9Y297 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BTRCQ9Y297 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BTRCQ9Y297 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BTRCQ9Y297 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms