Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NUDCQ9Y266 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NUDCQ9Y266 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NUDCQ9Y266 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NUDCQ9Y266 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
NUDCQ9Y266 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NUDCQ9Y266 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NUDCQ9Y266 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NUDCQ9Y266 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NUDCQ9Y266 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NUDCQ9Y266 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
NUDCQ9Y266 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NUDCQ9Y266 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NUDCQ9Y266 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NUDCQ9Y266 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUDCQ9Y266 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUDCQ9Y266 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUDCQ9Y266 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUDCQ9Y266 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NUDCQ9Y266 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NUDCQ9Y266 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NUDCQ9Y266 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
NUDCQ9Y266 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
NUDCQ9Y266 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NUDCQ9Y266 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NUDCQ9Y266 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NUDCQ9Y266 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUDCQ9Y266 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUDCQ9Y266 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUDCQ9Y266 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUDCQ9Y266 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUDCQ9Y266 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUDCQ9Y266 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUDCQ9Y266 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUDCQ9Y266 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUDCQ9Y266 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUDCQ9Y266 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUDCQ9Y266 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
NUDCQ9Y266 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUDCQ9Y266 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUDCQ9Y266 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUDCQ9Y266 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUDCQ9Y266 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NUDCQ9Y266 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NUDCQ9Y266 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NUDCQ9Y266 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NUDCQ9Y266 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NUDCQ9Y266 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NUDCQ9Y266 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NUDCQ9Y266 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NUDCQ9Y266 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NUDCQ9Y266 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NUDCQ9Y266 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NUDCQ9Y266 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NUDCQ9Y266 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NUDCQ9Y266 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NUDCQ9Y266 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NUDCQ9Y266 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NUDCQ9Y266 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NUDCQ9Y266 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NUDCQ9Y266 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NUDCQ9Y266 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NUDCQ9Y266 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NUDCQ9Y266 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NUDCQ9Y266 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NUDCQ9Y266 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NUDCQ9Y266 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NUDCQ9Y266 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NUDCQ9Y266 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NUDCQ9Y266 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NUDCQ9Y266 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NUDCQ9Y266 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms