Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms