Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms