Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNMA8BQ9ULN7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.31■■□□□ 1
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