Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms