Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FBXL4Q9UKA2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FBXL4Q9UKA2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.83
FBXL4Q9UKA2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXL4Q9UKA2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXL4Q9UKA2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXL4Q9UKA2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXL4Q9UKA2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXL4Q9UKA2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXL4Q9UKA2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXL4Q9UKA2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXL4Q9UKA2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXL4Q9UKA2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXL4Q9UKA2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXL4Q9UKA2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXL4Q9UKA2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXL4Q9UKA2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXL4Q9UKA2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms