Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms