Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms