Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPUSD1Q9UJJ7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms