Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ68

MSRA, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRAQ9UJ68 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms