Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms