Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms