Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLKQ9UBT6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms