Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
DKK4Q9UBT3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms