Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DNMT3BQ9UBC3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms