Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB4

ATXN10, Ataxin-10, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN10Q9UBB4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATXN10Q9UBB4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATXN10Q9UBB4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATXN10Q9UBB4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATXN10Q9UBB4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATXN10Q9UBB4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATXN10Q9UBB4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATXN10Q9UBB4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATXN10Q9UBB4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATXN10Q9UBB4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATXN10Q9UBB4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATXN10Q9UBB4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATXN10Q9UBB4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATXN10Q9UBB4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATXN10Q9UBB4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATXN10Q9UBB4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATXN10Q9UBB4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATXN10Q9UBB4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATXN10Q9UBB4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATXN10Q9UBB4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATXN10Q9UBB4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATXN10Q9UBB4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN10Q9UBB4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms