Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms