Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCDH10Q9P2E7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms