Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms