Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms