Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms