Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
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