Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms