Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms