Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GINM1Q9NU53 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms