Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms