Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAB6BQ9NRW1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms