Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MEPEQ9NQ76 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MEPEQ9NQ76 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MEPEQ9NQ76 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MEPEQ9NQ76 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MEPEQ9NQ76 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MEPEQ9NQ76 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MEPEQ9NQ76 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MEPEQ9NQ76 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MEPEQ9NQ76 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MEPEQ9NQ76 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MEPEQ9NQ76 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MEPEQ9NQ76 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MEPEQ9NQ76 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MEPEQ9NQ76 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MEPEQ9NQ76 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MEPEQ9NQ76 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MEPEQ9NQ76 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MEPEQ9NQ76 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MEPEQ9NQ76 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
MEPEQ9NQ76 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MEPEQ9NQ76 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MEPEQ9NQ76 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MEPEQ9NQ76 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MEPEQ9NQ76 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
MEPEQ9NQ76 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MEPEQ9NQ76 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MEPEQ9NQ76 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MEPEQ9NQ76 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MEPEQ9NQ76 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MEPEQ9NQ76 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MEPEQ9NQ76 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MEPEQ9NQ76 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MEPEQ9NQ76 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MEPEQ9NQ76 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MEPEQ9NQ76 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MEPEQ9NQ76 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MEPEQ9NQ76 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MEPEQ9NQ76 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MEPEQ9NQ76 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MEPEQ9NQ76 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MEPEQ9NQ76 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
MEPEQ9NQ76 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MEPEQ9NQ76 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MEPEQ9NQ76 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MEPEQ9NQ76 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MEPEQ9NQ76 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MEPEQ9NQ76 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MEPEQ9NQ76 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
MEPEQ9NQ76 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MEPEQ9NQ76 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MEPEQ9NQ76 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MEPEQ9NQ76 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MEPEQ9NQ76 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MEPEQ9NQ76 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MEPEQ9NQ76 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MEPEQ9NQ76 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MEPEQ9NQ76 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MEPEQ9NQ76 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MEPEQ9NQ76 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MEPEQ9NQ76 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MEPEQ9NQ76 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MEPEQ9NQ76 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MEPEQ9NQ76 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MEPEQ9NQ76 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MEPEQ9NQ76 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MEPEQ9NQ76 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MEPEQ9NQ76 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MEPEQ9NQ76 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MEPEQ9NQ76 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MEPEQ9NQ76 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MEPEQ9NQ76 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MEPEQ9NQ76 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MEPEQ9NQ76 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MEPEQ9NQ76 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MEPEQ9NQ76 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MEPEQ9NQ76 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MEPEQ9NQ76 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MEPEQ9NQ76 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MEPEQ9NQ76 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MEPEQ9NQ76 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MEPEQ9NQ76 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MEPEQ9NQ76 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MEPEQ9NQ76 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MEPEQ9NQ76 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MEPEQ9NQ76 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MEPEQ9NQ76 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MEPEQ9NQ76 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MEPEQ9NQ76 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MEPEQ9NQ76 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MEPEQ9NQ76 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MEPEQ9NQ76 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MEPEQ9NQ76 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MEPEQ9NQ76 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MEPEQ9NQ76 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MEPEQ9NQ76 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MEPEQ9NQ76 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MEPEQ9NQ76 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MEPEQ9NQ76 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MEPEQ9NQ76 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms