Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNCQ9H7C4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms