Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E9

BRD8, Bromodomain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD8Q9H0E9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRD8Q9H0E9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRD8Q9H0E9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRD8Q9H0E9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRD8Q9H0E9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRD8Q9H0E9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRD8Q9H0E9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRD8Q9H0E9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BRD8Q9H0E9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRD8Q9H0E9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRD8Q9H0E9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRD8Q9H0E9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRD8Q9H0E9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRD8Q9H0E9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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