Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms