Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5J6

Shpk, Sedoheptulokinase, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShpkQ9D5J6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ShpkQ9D5J6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms